| Discovery HRM™-MS Proteomics [TrueDiscovery™] HRM™- Mass Spectrometryにより、組織、培養細胞、血漿/血清・尿・CSF等の生体サンプル等の様々なサンプルにおいて、同時に最大10,000種類のタンパク質の定量が可能です。正常サンプルと疾患サンプルとの比較によるバイオマーカー探索や、コントロールサンプルと化合物処理サンプルとの比較によるMOAの同定等、創薬研究の様々な分野で有用です。数100~数1,000のサンプルスケールでも対応可能です。 |
《アッセイタイプ(workflow)と検出可能なタンパク質数》
| Sample type / HRM workflow | SpeeD | ID | ID+ | HighD |
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| Cell Line / tissue | 3,000-5,000 | 4,000-5,000 | 5,000-7,000 | 6,000-9,000+ |
| Plasma / serum | 300-450 | 350-500 | 400-600 | N/A |
| Depleted* plasma / serum | 400-700 | 500-800 | 600-1,000 | 2,700 |
| CSF | 500-700 | 600-900 | 700-1,200 | 900-1,500 |
| Urine | 600-1,000 | 800-1,200 | 1,000-1,800 | 1,700-2,600 |
* Depletion of the 14 most abundant proteins before HRM/DIA-MS
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《サンプルタイプと必要量》
| Sample type | Cell Culture | Tissue | Plasma / Serum | CSF | Urine |
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| Required amount | 105-106 cells | 1-5 mg fresh frozen
2x5μm FFPE slices
(each ~50-100 mm2) | 10 μL (non-depleted)
100 μL (depleted) | 100 μL | 500 μL |
| Storage conditions | fresh frozen
freeze-dried | fresh frozen
freeze-dried
FFPE | fresh frozen | fresh frozen | fresh frozen |
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| 《Case Study: Identification of plasma biomarkers for response to anti-PD1 treatment》 |
Unbiased HRM Proteomic Profiling of Tumor Biopsies
Selected Proteins cluster Subjects into Groups with Distinct Survival Probabilities
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| LiP-MS Target Deconvolution [TrueTarget™] Limited Proteolysis (LiP) Mass Spectrometryにより、試験化合物等の結合により構造変化したタンパク質を検出し、ターゲットタンパク質の解析を行います。ターゲットの同定だけでなく、off-targetの検証にも有用です。 |
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| Targeted PRM-MS Proteomics [TrueSignature™] Multiple Reaction Monitoring (MRM)/ Parallel Reaction Monitoring (PRM)- Mass Spectrometryにより、サンプルにおける特定のターゲットタンパク質の定量を行います。ターゲットタンパク質に対するSIS peptideを選択・作製するために、実際にターゲットタンパク質をサンプルから単離し切断してペプチドを選択する方法と、in silicoで検証してペプチドを選択する方法の2パターンがあります。 |
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